El trabajo “New Insights into the Geometry and Topology of DNA Replication Intermediates” se publicó en la revista Biology. El mismo fue elaborado conjuntamente por investigadores del Grupo de Investigación en Bioinformática (GBI) y del Núcleo de Investigación y Desarrollo Tecnológico (NIDTEC) de la FP-UNA y del Centro de Investigaciones Biológicas Margarita Salas (CSIC, España).
Son autores: Víctor Martínez (GBI), Edith Ruiz-Díaz (GBI), Delia Cardozo (GBI), Cristian Cappo (NIDTEC), Christian E. Schaerer (NIDTEC), Jorge Cebrián (CSIC), Dora B. Krimer (CSIC) y María José Fernández-Nestosa (GBI).
Resumen simple
Las propiedades topológicas y conformacionales de los intermediarios de replicación del ADN cambian tras la desproteinización. Presentamos las primeras simulaciones de dinámica molecular de moléculas parcialmente replicadas, tanto en las etapas tempranas como tardías del proceso de replicación del ADN. La desproteinización facilita la distribución del estrés torsional entre las regiones replicadas y no replicadas del intermediario de replicación para alcanzar el equilibrio termodinámico. Nuestras simulaciones identificaron cinco componentes del estrés torsional y cuatro tipos de eventos de colisión en moléculas parcialmente replicadas. El signo topológico y la quiralidad de los eventos de colisión se correlacionaron con la progresión de la replicación del ADN, proporcionando nuevas perspectivas sobre la función coordinada de las topoisomerasas.
Cabe resaltar que este artículo pertenece a la edición especial del “Young Investigators in Biochemistry and Molecular Biology”.
Enlace al artículo: https://www.mdpi.com/2079-7737/14/5/478
